Ugrás a tartalomhoz

EU Kiválósági KözpontISO 9001

ERCIMW3C MemberFraunhofer Projektközpont

Miklós István, Ph.D., tudományos főmunkatárs, kutató
Miklós István
Cím: 1111 Budapest, Lágymányosi u. 11.
Szoba: L412
Telefon: +36 1 279 6172
E-mail: miklos.istvanEZT_TOROLJE_KI@EZT_TOROLJE_KIsztaki.hu
Honlap: www.renyi.hu/~miklosi/
Részleg: Informatikai Kutatólaboratórium

Miklós István fő kutatási területe a bioinformatika és elméleti számítástudomány, azon belül is a sztochasztikus modellek, dinamikus programozás, Markov lánc Monte Carlo, Markov láncok konvergenciasebessége, sztochasztikus approximációk, #P-teljesség, FPRAS, FPAUS.

Publikációk

[Időrendben] [Kategóriákba sorolva ]

2015.

A decomposition based proof for fast mixing of a Markov chain over balanced realizations of a joint degree matrix
Szerzők: Erdős, Péter; Miklós, István; Toroczkai, Z.
Megjelenés: 2015.
Megjelent: SIAM JOURNAL ON DISCRETE MATHEMATICS (Kötetszám: 29, Füzetszám: 1, Oldalszám: 481-499)
Sampling and counting genome rearrangement scenarios
Szerzők: Miklós, István; Heather, Smith
Megjelenés: 2015.
Megjelent: BMC BIOINFORMATICS (Kötetszám: 16, Füzetszám: 14, Oldalszám: S6)
Exact sampling of graphs with prescribed degree correlations
Szerzők: Bassler, K.E.; Del Genio, C.I.; Erdős, Péter; Miklós, István; Toroczkai, Z.
Megjelenés: 2015.
Megjelent: NEW JOURNAL OF PHYSICS (Kötetszám: 17, Oldalszám: 83052)
Efficient representation of uncertainty in multiple sequence alignments using directed acyclic graphs
Szerzők: Herman, Joseph L; Novák, Ádám; Lyngsø, Rune; Szabó, Adrienn; Miklós, István
Megjelenés: 2015.
Megjelent: BMC BIOINFORMATICS (Kötetszám: 16, Füzetszám: 108, Oldalszám: 1-26)
Efficient representation of uncertainty in multiple sequence alignments using directed acyclic graphs
Szerzők: Herman, Joseph L; Novák, Ádám; Lyngso, Rune; Szabó, Adrienn; Miklós, István; Hein, Jotun
Megjelenés: 2015.
Megjelent: BMC bioinformatics (Kötetszám: 16, Füzetszám: 1, Oldalszám: 108-108)

2014.

Counting and sampling SCJ small parsimony solutions
Szerzők: Miklós, István; Kiss, Sándor; Tannier, Eric
Megjelenés: 2014.
Megjelent: THEORETICAL COMPUTER SCIENCE (Kötetszám: 552, Oldalszám: 83-98)

2013.

Towards random uniform sampling of bipartite graphs with given degree sequence
Szerzők: Miklós, István; Erdős, Péter; Soukup, Lajos
Megjelenés: 2013.
Megjelent: ELECTRONIC JOURNAL OF COMBINATORICS (Kötetszám: 20, Füzetszám: 1)

2012.

Approximating the number of Double Cut-and-Join scenarios
Szerzők: Miklós, István; Tannier, E
Megjelenés: 2012.
Megjelent: THEORETICAL COMPUTER SCIENCE (Kötetszám: 439, Oldalszám: 30-40)

2010.

RNA Structure Prediction
Szerzők: Miklós, István
Megjelenés: 2010.
Megjelent: David Fenyö (ed.), Compiutational Biology, Methods in Molecular Biology 673 (Kötetszám: 673, Oldalszám: 19-36)
Reticular alignment: a progressive corner-cutting method for multiple sequence alignment
Szerzők: Szabó, Adrienn; Novák, Á.; Miklós, István; Hein, J.
Megjelenés: 2010.
Megjelent: BMC Bioinformatics (Kötetszám: 11 (57, Oldalszám: 1-19)
A simple Havel-Hakimi type algorithm to realize graphical degree sequences of directed graphs
Szerzők: Erdős, P.; Miklós, István; Toroczkai, Z.
Megjelenés: 2010.
Megjelent: Elec. J. Combinatorics (Füzetszám: 17(1), Oldalszám: R66)
The Metropolized Partial Importance Sampling MCMC mixes slowly on minimum reversal rearrangement paths
Szerzők: Miklós, István; Mélykúti, B.; Swenson, K.
Megjelenés: 2010.
Megjelent: ACM/IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Füzetszám: 4(7), Oldalszám: 763-767)
MCMC network: graphical interface for Bayesian analysis of metabolic networks
Szerzők: Friedman, Anna Eszter; Miklós, István; Hein, J.
Megjelenés: 2010.
Megjelent: ERCIM News (Füzetszám: 82, Oldalszám: 31-32)
Introduction to Algorithms in Bioinformatics
Szerzők: Miklós, István
Megjelenés: 2010.
Megjelent: Electronic notes.
Journal of Computational Biology
Szerzők: Miklós, István; Ciccarelli, Francesca D.
Megjelenés: 2010.
Megjelent: (selected papers from RECOMB Comparative Genomics 2009) (Kötetszám: Septem, Oldalszám: 1095-1344)
Bayesian sampling of genomic rearrangement scenarios via double cut and join
Szerzők: Miklós, István; Tannier, E.
Megjelenés: 2010.
Megjelent: Bioinformatics (Kötetszám: 26, Füzetszám: 24, Oldalszám: 3012-3019)

2009.

Streamlining and large ancestral genomes in Archaea inferred with a phylogenetic birth-and-death model
Szerzők: Csürös, M.; Miklós, István
Megjelenés: 2009.
Megjelent: Mol. Biol. Evol. (Füzetszám: 26(9), Oldalszám: 2087-2095)
Stochastic models of sequence evolution including insertion-deletion events
Szerzők: Miklós, István; Novák, Á.; Satija, R.; Lyngsoe, R.; Hein, J.
Megjelenés: 2009.
Megjelent: Statistical Methods in Medical Research (Kötetszám: 18, Füzetszám: 5, Oldalszám: 453-485)
Efficient sampling of parsimonious inversion histories with application to genome rearrangement in Yersinia
Szerzők: Miklós, István; Darling, A. E.
Megjelenés: 2009.
Megjelent: Genome Biology and Evolution (Kötetszám: 1, Füzetszám: 1, Oldalszám: 153-164)
Degree-based graph construction
Szerzők: Kim, P.; Toroczkai, Z.; Erdős, P.; Miklós, István; Székely, L.
Megjelenés: 2009.
Megjelent: J. Phys. A., (Füzetszám: 42(39), Oldalszám: 3920011-39200110)
BigFoot: Bayesian Alignment and Phylogenetic Footprinting with MCMC BMC
Szerzők: Satija, R.; Novák, Á.; Miklós, István; Lyngsoe, R.; Hein, J.
Megjelenés: 2009.
Megjelent: Evolutionary Biology (Kötetszám: 9:217)

2008.

Statistical multiple alignment
Szerzők: Miklós, István
Szerkesztő: Kao, Ming-Yang
Megjelenés: 2008.
Megjelent: Encyclopedia of algorithms. (Oldalszám: 892-894)
Stochastic Models of Sequence Evolution including Insertion-Deletion events Statistical Methods in Medical Research
Szerzők: Miklós, István; Novák, Á.; Satija, R.; Lyngsoe, R.; Hein, J.
Megjelenés: 2008.
Megjelent: (Terjedelem: 29 oldal)
StatAlign: an extendable software package for joint Bayesian estimation of alignments and evolutionary trees
Szerzők: Novák, Ádám; Miklós, István; Lyngso, Rune; Hein, Jotun
Megjelenés: 2008.
Megjelent: Bioinformatics (Kötetszám: 24, Füzetszám: 20, Oldalszám: 2403-2404)
SimulFold: simultaneously inferring RNA structures including pseudoknots, alignments, and trees using a Bayesian MCMC framework
Szerzők: Meyer, I. M.; Miklós, István
Megjelenés: 2008.
Megjelent: PLoS Computational Biology (Kötetszám: 3, Füzetszám: 8 (e14)
How reliably can we predict the reliability of protein structure predictions?
Szerzők: Miklós, István; Novák, Ádám; Dombai, Balázs; Hein, Jotun
Megjelenés: 2008.
Megjelent: BMC Bioinformatics (Kötetszám: 9, Füzetszám: 137, Oldalszám: 1-14)
Dynamics of genome rearrangement in bacterial populations
Szerzők: Darling, A. E.; Miklós, István; Ragan, M. A.
Megjelenés: 2008.
Megjelent: PLoS Genetics (Kötetszám: 4, Füzetszám: 7 (e10, Oldalszám: 1-15)

2007.

Bioinformatics
Szerzők: Miklós, István
Szerkesztő: Iványi, A.
Megjelenés: 2007.
Megjelent: Algorithms of informatics. Vol. 2. Applications. (Oldalszám: 973-1011)
Algorithms of Bioinformatics
Szerzők: Miklós, István
Szerkesztő: Ivanyi, Antal
Megjelenés: 2007.
Megjelent: Algorithms of Informatics (Oldalszám: 973--1011)

Új keresés